Você não precisa recuperar toda máquina virtual para recuperar apenas alguns arquivos. Faça isso com o file-level Restore.
O WSpeed Backup para Vmware a partir da versão 5.6 permite executar a restauração no nível de arquivo para máquinas virtuais VMWare simplesmente clicando com o botão direito do mouse em qualquer uma dessas máquinas na guia Armazenamento de Backup e clicando em Restauração no Nível de Arquivo.
Logo após o aparecimento do gerenciador de arquivos, você poderá selecionar os arquivos necessários e restaurá-los no local especificado.